Ekstrakurikuler yang ada di SMK Swasta HKBP Pematangsiantar terdiri dari dua kategori yakni wajib dan tidak wajin bisa dipilih sesuai dengan hobby dan bakat siswa.
Ekstrakurikuler wajib:
- Les Komputer dan simulasi digital
- Pendidikan Pramuka
- Les sore Praktik
Ektrakurikuler Pilihan:
- Les mengemudi (bagi siswa TKR Gratis)
- Izurai Band
- Kungfu
- Futsal
- Volly Ball
- Musik Tradisioal
- PKS
- Paskibras
- Badminton
- Tennis Meja